若為簡單頭部、脊柱檢查，可能15-20分鐘即可完成；若為復雜檢查如腹部增強掃描，可能需要20分鐘；若為更復雜檢查如心臟檢查，可能需要30分鐘左右。因此，通常情況下磁共振檢查需要進行15-30分鐘。但有時為過多患者可進行檢查，醫生可能會將掃描簡化到10分鐘，可能會減去較多序列或縮短時間，對診斷可能會造成一定影響。因此，不建議患者在時間上進行過多糾纏，醫生會根據疾病需要合理安排檢查時間。對于病情比較復雜的患者，醫生可能會進行更精細的檢查，若患者病情比較簡單，可能檢查時間也較短。