根據不同檢查部位及不同檢查要求，磁共振檢查時間不同。一般部位，例如頭顱平掃，頸椎、胸椎、腰椎檢查，每個部位大約需要10分鐘。大關節檢查大約需要10-20分鐘，上腹部檢查需要患者呼吸配合，根據患者屏氣情況，檢查時間約在20-30分鐘不等。如果需要增強掃描，檢查時間會相應增加5-10分鐘。 磁共振檢查全過程需要患者保持受檢部位不動，如果遇到患者煩躁或年齡較大患者，會在檢查前向患者簡單介紹檢查步驟，消除緊張情緒，在檢查過程中與患者通話，必要時讓親屬陪在患者旁邊，讓親屬握住患者手，增加安全感。 磁共振檢查沒有輻射，所以基本對身體無傷害。磁共振檢查不要帶入任何金屬物品，存在金屬植入物患者需要在檢查前告知醫生，判斷是否可以進行磁共振檢查。患者在檢查過程中需要放松心態，保持平靜，幽閉恐懼癥患者一般不能完成磁共振檢查。