乙肝小三陽轉陰后，復發的幾率較低，但還是存在一定的復發性。因為小三陽轉陰，主要是指表面抗原轉陰，或者表面抗原陰轉、表面抗體陽轉，這種情況稱為乙肝的臨床治愈。即使表面抗原轉陰，乙肝病毒在體內的含量非常低，但在肝細胞細胞核中仍然存在非常少量的cccDNA，這種DNA在患者機體免疫力下降的情況下會被激活，病毒就會出現再復制，就會導致肝臟的損傷。機體免疫力下降的原因，主要是患者長期過度勞累或者大量飲酒，或者長期應用免疫抑制劑。比如長期應用激素或者激素類的免疫抑制劑，會導致免疫力下降，就會使肝細胞核內非常少量的cccDNA復燃，使病毒再次復制、再次激活，就會出現乙肝復發。但對于大部分的乙肝小三陽轉陰后的患者，如果一直處于一個正常的生活狀態，免疫力正常的情況下，不飲酒、不勞累、不應用免疫抑制劑，一般不會復發。