骨結核在確診過程中除了需要肺結核的確診檢查，還包括結核菌素皮試、抽血化驗、γ-干擾素釋放試驗以及血常規等檢查。骨結核檢查還需要特殊的檢查，常見的CT檢查，CT檢查能夠明確地發現病灶部位、病灶破壞程度等。除了常規的CT或局部的拍片等檢查之外，患者還會進行磁共振檢查，特別是脊柱等特殊的骨結核，需要磁共振進行探查。 CT檢查和核磁共振檢查是針對不同病變特點的兩個特征性檢查，當患者出現化膿或其它部位需要判斷是否患有結核時需要結合兩種檢查。骨結核因為發病特點的不同，將CT和核磁共振兩者結合起來進行檢查可以更好地探明病情，特別是外科醫生在手術過程中或手術前需要明確骨結核的病變特點，并以此為手術制定合理方案。所以骨結核的兩個最常用檢查，即CT和核磁共振，有時需要一起進行。