小便時尿道刺痛，有可能是感染或者其他原因所導致，如果是細菌感染造成，常用的藥物主要是抗菌素，比如喹諾酮類抗菌素、抗菌頭孢類等，如果是其他因素，也有對癥的藥物，具體如下：1、喹諾酮類抗菌素：比較常用的藥物包括左氧氟沙星、莫西沙星，或者氟哌酸等；2、抗菌頭孢類：常用的廣譜抗菌頭孢類，比如頭孢地尼、頭孢呋辛、頭孢克洛等；3、其他：如果感染不是細菌所導致，可能是支原體或者衣原體造成，這時可以使用阿奇霉素治療。在病人癥狀比較重的時候，可以讓病人使用輔助性的中成藥，比如熱淋清、尿感寧，對緩解癥狀效果比較好。