克羅恩病的肛瘺是克羅恩病的并發癥，主要有以下幾種特點：1、帶有其他系統疾病：克羅恩病是全身系統的疾病，伴有肛瘺的同時，腸道、食管、胃等其他系統也有病變，伴發全身的其他系統疾病較多；2、比較復雜：外瘺較少、內瘺較多，治療比較麻煩、發病比較緩慢；3、引起直腸狹窄：可能會引起周圍肛門和直腸狹窄，因為瘺管反復生長且內瘺較多；4、不易愈合：普通肛瘺可能經過掛線治療、切開、切除治療能夠愈合，克羅恩病肛瘺一般不能治愈，治療的主要目的是緩解癥狀。如克羅恩病肛瘺伴發周圍感染，引起肛門周圍疼痛，可以切開引流，將感染物引流出來，但目的并不是治愈肛瘺。