胃食管反流初期以反流和燒心為主要臨床表現，平臥或者體位變化時胃和十二指腸內容物會反流到食道，從而感到不適，同時胸骨后還會出現燒灼樣感覺，甚至嘈雜樣感覺。但是與活動無關，可以給予促動力藥，以及抑酸藥，可以較好控制癥狀。 如果上述癥狀是活動誘發，則應該警惕心臟疾病。有些患者是以食管外癥狀為主，比如慢性咽炎，或者反復咳嗽、哮喘不容易控制，尤其是夜間發作明顯，可以給予試驗性治療，比如給予促動力藥與抑酸藥，2周標準劑量治療。如果癥狀緩解，則表明是胃食管反流病引起，如果治療無效，則應該考慮其他病因。胃食管反流進一步發展會引起并發癥，比如較嚴重的食管潰瘍可能會出現胸骨后疼痛感，進食后會加重。反復發作的患者可以出現食管狹窄，甚至出現吞咽困難。長期反流性食管炎可能會導致Barrett食管，甚至食管腺癌，此時需要定期胃鏡檢查，幫助明確診斷。