食道反流患者根據反流物的性質，即反流物呈酸性或堿性，可出現不同的癥候群，需依據其性質和并發癥的情況，具體問題，具體對待。酸反流的癥狀主要包括反酸、燒心、噯氣、呃逆、胸骨后疼痛、進食后哽噎感等。堿反流，即膽汁反流，可出現口干、口苦、胸骨后不適感、胸骨后疼痛、噯氣、呃逆，其中口苦、口臭感較明顯。無論酸反流或堿反流，嚴重時均引起并發癥，包括食道炎，即食物通過時有哽噎感、疼痛感，以及食管縮窄，為反復的炎癥刺激所致。長期的反流物刺激可引起食道黏膜性質改變，比如食道黏膜變成胃黏膜，甚至腸黏膜，即Barrett食管或者腸化生，可誘發食道癌的發生。長期的反流可引起咽炎、支氣管炎、肺炎、胸膜炎等，甚至全身感染等嚴重并發癥。