原發性腦干損傷的臨床癥狀，可能有很多的表現，根據損傷的不同的部位，有具體不同的表現。1、所有運動感覺的神經傳導束都要經過腦干，所以無論腦干什么部位損傷，都可能損傷運動感覺的纖維，可以出現運動障礙、偏癱、四肢癱、雙下肢癱；2、可以出現感覺的障礙，腦干是交叉性的感覺障礙，頭面部是一側，肢體是對側這種感覺障礙；3、腦干有很多神經核團，神經核團也會有損傷，會有不同的表現。12對無神經的核團都在腦干，都可以有不同程度的損傷，哪個神經核團的損傷，就表現為哪個地方的臨床表現；4、腦干還有上行網狀激活系統，一旦損傷，就會導致患者出現昏迷；5、生命中樞在腦干，腦干損傷了之后，會導致心跳、呼吸停止，發生死亡。