吞咽困難不能等同于食管癌。其實食管癌的典型癥狀并不是吞咽疼痛，而是吞咽梗阻感。吞咽疼痛有很多其它的原因，例如咽喉發炎也可以引起吞咽的疼痛，食管炎、食道炎、食管反流等都可以引起吞咽疼痛。 食道癌也可能會出現吞咽的疼痛。如果食管癌癌腫局部有潰爛，吞咽食物的刺激會導致疼痛。所以吞咽疼痛并不能等于是食管癌，診斷食管癌最關鍵的是通過胃鏡取病理組織送檢，進行病理學的診斷。