吞咽疼痛有以下原因：1、感染性疾病：如病毒、細菌、支原體或其他病原體感染，如扁桃體炎、咽炎、口腔潰瘍等，感染性疾病引起吞咽困難，通過控制感染得到緩解可使疼痛消失；2、機械刺激：進食堅硬食物或魚刺刺傷黏引起喉嚨腫痛，出現吞咽困難的情況；3、腫瘤：鼻咽癌、扁桃體腫物、喉癌等腫瘤性疾病，早期患者沒有癥狀，但當患者感覺疼痛時可能到中晚期；4、心臟病：心肌梗死出現咽喉疼，主要因為咽喉和心臟神經受到同一階段脊神經的支配。當心肌梗死時刺激神經產生疼痛，擴散到咽部迷走神經，誘發吞咽疼痛；5、舌咽神經痛：舌咽神經是顱內神經疼痛的誘發因素，吞咽時出現陣發性電擊痛。