大部分小兒心肌炎經過合適的、合理的治療和休息，數月甚至數年治療，絕大部分孩子是可以治愈的。部分孩子持續半年以上不緩解、病情反復，會留下后遺癥，具體如下： 1、運動后乏力、胸悶、憋氣等癥狀，遷延1年以上，持續1年以上，會進入慢性期，慢性期的孩子會出現慢性心功能不全、慢性心力衰竭，年數久了以后會出現擴張性心肌病，最終死于心力衰竭； 2、有些孩子會出現各種早搏，比如房性早搏、室性早搏、室性心動過速、房性心動過速； 3、有的孩子會出現各種傳導阻滯，一度阻滯心率是沒有問題的，二度、三度傳導阻滯時，心跳會有漏搏、有停頓，三度房室傳導阻滯最嚴重，心率很慢，心率只有40-50次，這時腦供血不足，會造成嚴重的缺氧，孩子經常會出現暈厥、甚至猝死。所以對于心肌炎的孩子，要定期進行觀察、隨訪、定期檢查。