小兒心肌炎是否會有后遺癥，不同孩子會有不同的結果。大部分孩子經過積極的治療，充分的休息不會遺留嚴重后遺癥，但是有一少部分孩子有可能會留有后遺癥。比如遺留有心律失常，如早搏、傳導阻滯，心跳比較不規則或者心跳比較慢、異常的快都有可能。還有一些孩子有可能遺留有心衰，恢復比較慢，然后有一個慢性心肌炎或者長期心功能相對正常比較低的一個狀態。有一些孩子在急性心肌炎的時候造成了心臟擴大，在以后可能心臟大小想恢復正常也需要一定的時間。