女性發生肛瘺一般對懷孕沒有關系，但孕婦在孕期發生肛瘺時盆腔充血，體質不如正常人健康的情況下，在發生感染時處理比較復雜，比如因為有胎兒的存在，對于抗生素用藥以及手術都造成一定困難。 所以建議需要懷孕的女性在懷孕前最好將已經出現的肛瘺進行處理，包括去除痔瘡等會導致懷孕期間出現問題的疾病，否則會嚴重影響懷孕，只有治愈后才能使孕期安全度過。