低位直腸癌一般指距肛門6-7cm以下的腫瘤。手指可能有6-8cm左右，所以低位直腸癌在做檢查時，最好的檢查手段是肛門指檢，可以觸及直腸腫瘤，直觀感受腫瘤大小、活動度，范圍等。因此指檢是最初的體格檢查內容。 除手指指檢之外，還需要進行其它輔助檢查，比如直腸磁共振、盆腔CT，以及胸腹部CT。直腸局部最主要的是直腸磁共振，因為磁共振與CT最大差別在于影像學剖析內容不同，磁共振更關注腸周圍淋巴結。對于稍微偏遲的Ⅱ、Ⅲ期直腸腫瘤患者，通過磁共振可以了解到T分期，腫瘤浸潤以及周圍淋巴結。 直腸的超聲以及超聲探頭可通過肛門進入觀察直腸腫瘤大小、浸潤范圍。此方法一般針對相對偏早期直腸癌，比如T1期，腫瘤浸潤很淺，此時可以通過超聲了解其浸潤深度。