腸鏡檢查分為普通腸鏡和無痛腸鏡，無痛腸鏡是在麻醉下做腸鏡檢查，沒有特別感覺，完全是在睡眠狀態下進行腸鏡檢查。但是如果是做普通腸鏡檢查，沒有麻藥的情況下，腸鏡檢查最常出現的感覺是脹痛，類似于想上廁所，特別是想排大便的脹痛。因為在做腸鏡檢查時，需要通過腸鏡向腸腔內注氣，才能更好地將腸腔展開，之后進一步進鏡，并且注氣量也需要控制，如果注氣量特別大，病人脹痛會嚴重，腸鏡也會困難。雖然是適量脹氣，但是被檢查者依會感到腹部脹滿不適。腸腔不是直管道，在腸鏡下拐彎時可能會感到疼痛，甚至絞疼感，但是這種不適通常為一過性。腸鏡拐彎后癥狀也會緩解，而且隨著氣體排出腸腔，腹部脹痛通常會消失。因此大部分人能夠耐受普通腸鏡檢查，保持放松，避免特別緊張，配合醫生和護士，均可以完整進行此項檢查。