治療夜間咳嗽需查明原因進行對因治療，未查明原因前也可進行試驗性治療，具體如下：1、查明原因進行對因治療：出現夜間咳嗽時要先分辨咳嗽原因。若夜間咳嗽持續很長時間，很有可能是咳嗽變異性哮喘，因為咳嗽變異性哮喘的咳嗽特點是在夜間咳嗽或凌晨咳嗽，而且此類咳嗽為陣發性干咳。咳嗽變異性哮喘患者的胸部影像學正常，若患者做胸片發現胸部影像學正常，但又經常在夜間咳嗽，很有可能是得了咳嗽變異性哮喘。此時可通過氣道激發試驗或氣道可逆試驗確診。雖然藥物可治療咳嗽，可使咳嗽的癥狀稍微緩解，但還是要針對引起咳嗽的病因進行治療。因此，明確診斷非常重要；2、試驗性治療：若沒有條件進行確診，可嘗試試驗性治療。試驗性治療可應用孟魯司特，孟魯司特是一種白三烯受體拮抗劑，孟魯司特有抗炎作用。若是咳嗽變異性哮喘引起的夜間咳嗽，應用孟魯司特有效。另外，也可應用一些鎮咳的藥物，例如復方甲氧那明，復方甲氧那明對過敏相關的咳嗽更有效。