根管治療麻醉需要打在牙根的根尖部，牙神經通過根尖部的根尖孔進入到牙齒，如果注射位置過高，注射在牙根中部或更高位置，麻藥不易滲透到根尖孔。因此在根管治療打麻藥時，需注射在靠近根尖孔部位，打到根尖孔部位后，麻藥通過自身的滲透作用和彌散性，逐漸突破黏膜下層和骨膜，通過根尖孔周圍的骨孔滲透到牙神經周圍，阻斷牙神經痛覺，因此根管治療注射麻藥的的部位應該在根尖部，才能達到良好麻醉效果。如果多顆牙進行根管治療，也可以注射阻滯麻醉，阻滯麻醉注射在神經干部位，神經干通常支配多顆牙，麻藥注射都可以進行根管治療操作，尤其下牙部位進行下牙槽神經阻滯麻醉，可以麻醉半側下頜牙，而進行多顆下頜牙治療時，阻滯麻醉效果會更好，減少用藥量，麻醉效果較好。