系統性紅斑狼瘡沒有首選藥，紅斑狼瘡在3-4年前是不能治療的病。目前治療藥物首先是激素，現在激素使用比較廣泛，它有強大的抗炎作用，對自身免疫性炎性疾病起效較快，需要根據病情使用。 如病情不嚴重如單純皮疹、面部紅斑，沒有其它臟器損傷，可不用激素。如果有重要臟器損傷等，激素必須選擇。面部紅斑等皮膚改變者常用氯喹、羥氯喹，有內臟損傷可以用免疫抑制劑如環磷酰胺，如果腎臟有損傷，可以用嗎替麥考酚酯等藥物，血液系統有影響者可以用環孢素等。