發生牙周膿腫的原因，在臨床上發現有這么幾點： 第一，就是牙周袋深部的炎癥，向深部的擴散，形成化膿性炎癥，這時候形成牙周膿腫； 第二，牙周治療的時候沒有徹底清除，也就是致病菌在深牙周袋底部有殘留，在機體免疫力低下的時候，可能還發生牙周膿腫； 第三，有一些糖尿病患者，以及全身性系統性疾病患者，他們的免疫力很低，感染的幾率較大，所以這樣的患者發生牙周膿腫的幾率非常高； 第四，有一些沒有經過規范化培訓的醫生，也許在操作的時候，在操作過程中誤將牙石探到了袋底的位置，這樣可能會引發牙周膿腫； 另外，還有解剖結構的特點，我們都知道牙有兩個根也好，三個根也好，兩個根三個根之間分叉的位置叫根分叉，這是很隱蔽的位置，一旦細菌在這個位置定植，這個位置就非常容易發生牙周膿腫。臨床醫生操作起來清潔起來也非常的困難，這是解剖因素決定的； 另外就是有一些毒性非常強的致病菌定植在牙周袋深部，也會在局部產生牙周膿腫。