現在大多數生殖中心，三代試管的成功率維持在40% - 50%。不同中心，在成功率上也可能有一定的差異，基本上都在此范圍內。影響三代試管嬰兒的成功率，其因素有多種，主要包括女方的年齡。比如女方是高齡，超過35歲，甚至是40歲，此年齡往往已經出現卵子質量下降，所以更容易出現移植之后的失敗。另外一個影響成功率的重要因素，就是子宮內膜的情況，包括子宮內膜的厚度、形態和血流等情況，也會明顯地對三代試管的成功率產生一定的影響。另外如果女性卵子質量較差，形成的胚胎質量也差。或者是男方因素，如精子質量偏差、DNA碎片偏高，也可能影響到胚胎的質量，造成胚胎的著床率降低、種植率降低，所以影響三代試管成功率的因素有很多。但是因為三代試管的胚胎進行了染色體的篩查，跟普通的試管相比，其已經把染色體異常的胚胎剔除出去。所以相對而言，三代試管的成功率跟普通的試管成功率差別不是很大。