第三代試管嬰兒同樣會出現空囊。空囊不一定是胚胎染色體的問題，第三代試管嬰兒主要是排出的胚胎的染色體問題，所以不能保證染色體正常的胚胎移植之后絕對能夠懷孕，而不出現胚胎停育的情況。胚胎停育和很多因素有關，常見于以下幾種情況：1、胚胎因素：胚胎停育既和胚胎本身有關，也和胚胎的質量有關，即與胚胎的染色體有關，有可能是胚胎質量下降，進而出現胚胎停育的情況；2、子宮環境：如宮腔出現較大的肌瘤壓迫子宮或出現宮腔畸形，也有可能會造成胚胎停育，或者子宮內膜特別薄的情況；3、母親自身疾病：如母親本身可能存在高血壓、糖尿病、血栓前狀態以及自身免疫性疾病，可能都會導致胚胎停育。總而言之，進行第三代試管嬰兒不能完全杜絕胚胎停育的情況，需要具體情況具體分析。另外，第三代試管嬰兒的過程中不一定篩選的胚胎完全沒有問題，需要注意極端的情況。