一般幽門螺桿菌吃藥的治療時間為10-14天，大部分在通過10-14天的規律治療后，能夠根除幽門螺桿菌。10-14天的治療，即標準4聯療法后，不管是否治愈，均不能再繼續用藥，需停藥滿1個月后，再進行幽門螺桿菌檢測，常用的是呼氣試驗，即碳13或者碳14的呼氣試驗，幫助判斷幽門螺桿菌是否根除。首次根除未治愈的患者，不建議立刻進行第二次根除治療。因為恢復細菌對于抗生素的敏感性，需一段時間的間隔，一般建議間隔3-6個月以上的時間，再進行第二次幽門螺桿菌根除。根除幽門螺桿菌的標準治療，即4聯藥物，包括質子泵抑制劑，還有兩類抗生素，以及鉍劑。這4類藥物聯合應用療程為10-14天，服藥過程中注意勿漏服。否則不容易殺死幽門螺桿菌，還可能容易誘導幽門螺桿菌耐藥。