無論是四聯還是三聯的幽門螺桿菌治療，在沒有幽門螺桿菌感染的情況下，均不建議預防性的進行殺滅幽門螺桿菌的治療。幽門螺桿菌的治療方案，以前在亞洲區以外使用三聯治療，隨著三聯的使用，耐藥性增加，亞洲區還是使用四聯治療。四聯中有兩種抗生素，使用的劑量和療程均相對較大。因此在使用抗生素的時候，會產生一定的副作用，相較于對抗，比如常用呼吸道、泌尿系，或消化道細菌感染的時候，使用抗生素的劑量要大，因此抗生素產生的副反應便會相對大，而且抗生素的使用、配伍有明確規定，而不是隨便幾種抗生素均可以隨便配，出現相互作用的機會會較高，配伍禁忌，以及副反應的發生幾率便會增加。因此在沒有幽門螺桿菌感染的時候，不建議進行殺滅幽門螺桿菌的治療。在殺幽門螺桿菌的時候，同時要用到質子泵抑制劑，本身質子泵抑制劑的使用，便有可能增加萎縮性胃炎的發生，以及胃息肉的發生，因此在沒有適應證的情況下，也不建議進行預防性的幽門螺桿菌四聯治療。另外金屬鉍劑的黏膜保護劑，即用在四聯里的藥物，本身便具有輕微的殺滅幽門螺桿菌的作用，同時認為帶金屬鉍劑的黏膜保護劑，目前在國外、國內消化專業，不推薦作為黏膜保護劑使用，而是只作為殺幽門螺桿菌的治療。