臨床上進行幽門螺桿菌四聯療法的療程是14天。很多患者在查體時都會發現幽門螺桿菌，進行治療時目前通常采用四聯療法。在療程在指南中，幽門螺桿菌四聯療法的療程是10-14天，如果有條件或患者的反應不是很大時，通常都把療程放在14天，此時治療效果會更好。但部分患者服藥后，可能副反應比較大，再就可能合并其他的基礎疾病，服藥后擔心肝腎功能受損的可能性比較大，此時也可以將療程放在10天。幽門螺桿菌四聯療法的療程固定在10-14天存在試驗依據，在大樣本的臨床觀察中發現，應用幽門螺桿菌四聯療法14天和使用比14天更長療效，治療效果基本相同，用藥時間延長，也不會增加療效。如果治療14天效果不好，表明細菌存在耐藥的情況，并不是說藥用的時間不夠，此時需要更改治療方案，而不是延長療程。