核磁共振檢查時部分患者反應反映舒適感較差，這是因為行磁共振檢查需將患者置于強大磁場內，用射頻脈沖激發產生共振信號，被機器攝取以后形成磁共振影像。在射頻脈沖激發過程中會產生較大噪聲，持續噪聲會使部分患者產生不適感。 另外磁共振檢查床較小、孔徑較窄，部分患者在進入磁共振檢查床時會有強烈的幽閉恐懼癥，會讓患者產生畏懼、恐懼等心理狀態，不能配合完成磁共振檢查。現在磁共振機器硬件水平不斷提高，可以極大減少噪聲對患者的影響。但部分患者由于幽閉恐懼癥現象的存在，仍可能產生強烈的不舒服、不舒適的感覺，進而影響磁共振影像檢查。