顱腦CT檢查主要查腦內的疾病，如果合并鼻竇炎癥、鼻竇囊腫等疾病，也可以通過顱腦CT進行檢查。當患者突發疾病，懷疑是腦血管病時，急診頭顱CT非常重要，可以排除是否有腦出血。無論腦實質出血還是蛛網膜下腔出血，都可以通過顱腦CT來明確。排除腦出血后可以按照腦梗死進行緊急溶栓，或按腦梗死、腦血管病進行抗栓治療等。頭痛、頭暈患者，也會做顱腦CT排除顱內疾病，如顱內腫瘤、腦出血、腦梗死、寄生蟲病等，都可以通過顱腦CT檢查。顱腦CT對于部分疾病，腦干部位的病變是盲區，有時需要進一步檢查頭顱核磁共振，明確腦干部位是否有病變。同時對于病變性質的定性很難判斷，常需要檢查頭顱核磁共振，甚至核磁共振增強進行明確。