細菌性心肌炎感染細菌時，可能造成全身菌血癥或敗血癥，即細菌隨著血液流經全身，引起心臟感染，最主要可引起心臟瓣膜或心臟本身感染。 細菌性引起的心臟瓣膜感染，多數情況瓣膜存在一定反流或關閉不全。如二尖瓣關閉不全、主動脈瓣關閉不全、三尖瓣瓣膜關閉不全，最主要的治療為明確感染細菌，而后長程抗菌素治療，用藥4-8周，需根據細菌不同類型進行治療。如果瓣膜被破壞，需由心外科醫生行瓣膜置換術置換瓣膜。