先天性孤獨腎和輸尿管芽發育異常有關系，是遺傳相關性疾病，但并不是遺傳病。在腎臟發育過程中，輸尿管芽往上長，長到上面后，頂端會長出腎臟。如果因為一些原因導致輸尿管芽發育停止，這側腎臟難以長出，會導致病人出現獨腎。獨腎一般對病人的腎功能沒有影響，另外一側腎臟可以完全代償這側腎臟的功能。但是畢竟病人只有一個腎，要注意盡量避免損傷腎臟的因素。常見的損傷性因素包括應用不明來源的中藥、保健品、草藥、土方，以及濫用抗菌素、止疼藥等，所以病人應盡量避免上述會損傷腎臟的因素。