PET-CT在腫瘤方面診斷應用廣泛，可以檢查出肺癌、乳腺癌、結直腸癌，在婦科方面可以查出卵巢癌、子宮內膜癌、宮頸癌、膀胱癌，上述腫瘤代謝可以增高，都可以運用PET-CT進行診斷。而對于部分病變，比如肝細胞癌、腦部腫瘤、胃印戒細胞癌，可能PET-CT代謝不高，即不容易發現病灶，可能出現假陰性情況。此外PET-CT檢查可以發現其它部位轉移灶，可以從另一個方面進行診斷。 如果為腫瘤，PET-CT上表現高代謝病灶，從圖片上即顯示為膿點，產生膿點原因即腫瘤葡萄糖代謝比正常葡萄糖代謝高，PET-CT運用顯像劑的葡萄糖類聚物，可以吸收更多葡萄糖，把腫瘤病灶顯現。PET-CT是一次性檢查，一次檢查可以觀察全身情況，不但可能發現原發病灶，還可發現其它器官轉移情況，或者其它病變，比如骨頭、顱內、腎上腺和其它器官的淋巴結轉移灶。