PET-CT可以檢查出癌癥，但是并非所有癌癥都能夠通過PET-CT檢查出。PET-CT采取同位素標記手段，所依賴的原理即腫瘤細胞本身是高代謝腫瘤，葡萄糖含量比較高，而PET-CT所采用FDG的特殊造影劑，能夠提前發現體內葡萄糖攝取水平高的細胞。腫瘤細胞糖酵解能力強，所以PET-CT能夠發現腫瘤細胞。如果部分腫瘤本身代謝不活躍，PET-CT則不一定能夠檢查出。對于肝癌的患者或者部分特殊胃癌類型，比如胃印戒細胞癌或者增殖相對比較緩慢的癌癥，以及特殊神經內分泌腫瘤，這類腫瘤糖酵解能力水平較低，可能使用PET-CT檢查不一定能夠檢查出。