連花清瘟膠囊和雙黃連通常不在一起使用，因為此兩種藥物部分成分重復，但功效、主治又有一定區別。連花清溫膠囊的主要成分較復雜，包括連翹、金銀花、炙麻黃、苦杏仁、石膏、甘草，還有綿馬貫眾、魚腥草、薄荷腦、廣藿香等，組分相當復雜。功效是清瘟解毒、宣肺泄熱，主要用于治療流行性感冒導致的一系列癥狀，包括發熱、惡寒、肌肉酸痛、鼻塞流涕等流感常見癥狀。雙黃連口服液也是一種中成藥，藥物組成是包括金銀花、黃芩和連翹，金銀花和連翹在連花清瘟膠囊中也有。而雙黃連口服液主要用于治療風熱感冒，包括發熱、咳嗽、咽痛等。治療感冒，重要的是要辨對證、用對藥。如果是風寒感冒，可以選用感冒清熱顆粒，風熱感冒可以使用雙黃連、銀翹解毒等，病毒性感冒可選用連花清瘟膠囊。