孩子發燒灌腸的副作用如下：1、腸道并發癥：容易出現腸道穿孔，因為孩子腸道較嬌嫩，用大量水或藥物灌腸，可能使腸道過度擴張，出現腸道穿孔，導致腹膜炎、休克，甚至危及生命；2、刺激性過大：孩子發燒如果沒有明顯的不適癥狀，不用考慮處理，因為發燒是人體正常的反射，是人對抗病原和細菌的重要的手段，如果沒有不適不用退燒，但灌腸本身對孩子造成的不適癥狀非常突出，不管是用冷鹽水、冷水，還是加藥，對孩子可能都刺激非常大，不僅起不到退燒的目的，而且會讓孩子更加不舒服；3、損傷免疫力：灌腸藥物常用的是冷鹽水，但很多時候灌腸的同時還加藥，尤其是加糖皮質激素或中藥，對孩子的副作用也較大，因為腸道的吸收功能非常強大，把激素吸到體內之后會損傷免疫力。