腦膿腫的MRI表現，主要為腦實質內大片的T1向上，成低信號表現；T2向上，成高信號的占位性病變。病變的中央位置有邊界相對清晰的囊性病變，在增強掃描時可以觀察到中央為壞死區，是一種低信號病變，沒有明顯的強化。周邊囊腫壁呈薄厚一致的環狀強化，在環狀的強化的外圍可以看到指狀水腫。由于腦膿腫常發生在大腦中動脈的供血區，所以這類病變多介于頂葉、額葉等部位。部分腦膿腫，比如耳源性腦膿腫，則常見于顳葉位置，有時還可以發生在小腦。因此腦膿腫在磁共振的表現具有明顯的特征性，尤其是囊壁薄厚均一、有張力感的圓形囊腫。出現典型表現的腦膿腫，通常能夠和腦腫瘤的囊壁強化進行較好的鑒別。