引起上牙膛疼痛的原因較多。常見是由于食物刺激，如食物過燙或劃傷局部黏膜造成。局部黏膜可能因為其它疾病導致損傷，如帶狀皰疹，其中三叉神經帶狀皰疹占帶狀皰疹的20%，如果分布于腭部，可以伴有神經痛，疼痛較為劇烈。 手足口病屬于兒童傳染病，病變發生在腭部會引起上牙膛疼。口腔念珠菌病、球菌性口炎以及接觸性口炎等病損，如果發生于上牙膛部位，均會引起不同程度的疼痛。還有口腔潰瘍位于上牙膛部分也會引起疼痛等，所以上牙膛疼痛主要是由多種病損發生于上腭部引起。