陰囊結石與睪丸結石區別較大。陰囊結石屬于較為少見的疾病，主要是由于先天性的陰囊病變，或陰囊囊腫引起的繼發性陰囊內結石樣改變。陰囊結石病變在陰囊部位，而睪丸結石的病變部位在睪丸，結石在睪丸實質內。睪丸結石引起的原因可能是睪丸存在炎癥，導致睪丸的鈣鹽沉積或炎癥后局部瘢痕性改變。陰囊結石和睪丸結石，通常都無明顯的臨床癥狀。在炎癥發作期，陰囊結石可能局部存在紅腫、疼痛等。在陰囊的皮膚可以摸到結節樣改變，拍X線會發現陰囊內存在不透X線的陰影。睪丸結石通常進行B超檢查時，可以發現睪丸內存在高回聲的影像學表現。陰囊結石和睪丸結石不等同于泌尿系統的其他結石，通常不會引起血尿、惡心或嘔吐等。