牙齦萎縮的原因是由于牙周組織吸收，尤其是牙槽骨吸收。隨著牙槽骨吸收，牙齦的位置也會逐漸萎縮到非正常的狀態，這就是常見的牙齦萎縮。治療牙齦萎縮目前最有效的辦法就是控制牙周病進展，牙周病若能夠及早發現并及早進行有效治療，同時牙周支持組織包括牙槽骨沒有明顯吸收，牙齦便不會產生明顯的萎縮。 如果牙槽骨，尤其是牙槽骨邊緣發生明顯吸收，牙齦退縮無法避免。在生物學上有生物學寬度的概念，是指牙齦的邊緣與牙槽骨的邊緣相匹配，牙槽骨的位置決定牙齦相應的位置。因此，最有效的辦法就是避免萎縮，如果已經發生退縮治療會相對困難，雖然有牙齦成形手術的技術進行治療，但其臨床效果并不穩定。