膽管癌和肝癌是不同的惡性腫瘤，通常不將膽管癌歸為肝癌。膽管細胞來源的惡性腫瘤，可以長在肝內、肝外。膽管癌指長在肝外的膽管，包括膽管上段癌、膽管中下段癌，而生長在肝臟內部小膽管來源的腫瘤，稱為肝內膽管癌，目前歸為原發性肝癌當中的一種類型，但其生物學特性與肝癌存在顯著區別。臨床上將膽管癌認為是肝外的膽管，而膽管癌的臨床表現、腫瘤標志物，均與肝癌存在較大區別。肝癌主要表現為肝內腫塊，而膽管癌主要表現為進行性加重黃疸、膽管擴張，影像學檢查可發現膽管壁有異常強化，或軟組織占位性疾病。膽管癌容易出現淋巴結轉移，也有可能會蔓延到肝臟，造成肝臟受損。因此膽管癌和肝癌也存在著一定的共性，需要進行鑒別診斷。