輸尿管鏡下取石手術比較安全，損傷較小，一般沒有并發癥。結石周圍伴有息肉、輸尿管有狹窄、有梗阻，結石合并感染，有可能增加手術并發癥風險。目前輸尿管結石手術設備較為完善，一般不會出現嚴重并發癥。常見并發癥有術后輕度血尿、發熱、輕度疼痛等。術后多喝水，注意休息，血尿可逐漸好轉。合并感染可能伴有發熱，注意休息、多喝水，必要時藥物治療。