潰瘍性結腸炎的診斷為排他診斷，排除一般腸炎、結核、阿米巴痢疾等疾病，根據臨床病史，以及腹痛、黏液膿血便、腹瀉等癥狀，結合內鏡下乙狀結腸和直腸炎癥、黏膜膿腫等病理表現，X線、CT發現狹窄或增粗、擴張等情況，可以診斷為潰瘍性結腸炎。具體鑒別診斷如下： 1、腸炎：表現為腹瀉，嚴重者可見黏液膿血便； 2、阿米巴痢疾：表現為腹瀉、發燒，果醬樣大便； 3、缺血性腸炎：表現為便血、發燒、腹痛； 4、淋巴瘤：表現為腹瀉、腹痛、發燒。