腹部MRI檢查相對CT檢查較為復雜，需經序列完成，一個部位包含3-6個序列，每個序列3分鐘左右，若序列較為特殊，則需5分鐘，一般共需15-20分鐘。但檢查時間與患者配合度密切相關，若患者配合度較高，呼吸較為規律，則15分鐘即可完成；若患者配合度不高，無法配合屏氣進行節律性呼吸，則檢查時間相應延長，多在1小時內完成。 此外腹部MRI檢查前，應確認患者體內是否有金屬植入物病史，若體內有金屬植入物則無法進行MRI檢查。