口腔潰瘍發作時最好不洗牙，因為發生口腔潰瘍會引起疼痛，特別是發生皰疹性口炎時，存在多個潰瘍面，大夫沒法進行洗牙。因為潰瘍面是一個敞開的創面，細菌、病毒會從創面入侵，所以臨床不主張在發生潰瘍時洗牙。因為潰瘍并不影響洗牙，但洗牙時，首先醫生很難操作，患者會發生疼痛。其次潰瘍的創面，如果存在細菌便可由此侵入人體。因為黏膜實際是起到很好的保護作用，潰瘍的部位沒有黏膜的覆蓋，所以細菌能夠從此侵入。其實牙周潔治術，也會形成菌血癥，所以可以等潰瘍愈合再洗牙。除非潰瘍特別嚴重無法愈合，特別需要牙周潔治時，可進行選用。一般最常見的是復發性口腔潰瘍，7-10天便可痊愈，痊愈后可進行洗牙，以減少在洗牙中發生感染的幾率，同時也減少疼痛。及時在發生潰瘍時刷牙，患者也應盡可能避開潰瘍部位，即不可激惹潰瘍面而發生疼痛，主要也是為保護患者自己的健康。