卵巢囊腫會不會影響懷孕根據囊腫的類型來定。卵巢囊腫類型包括卵巢漿液性囊腺瘤、卵巢黏液性囊腺瘤、卵巢子宮內膜異位癥囊腫，子宮內膜異位癥囊腫又稱為巧克力囊腫。一般黏液性囊腺瘤和漿液性囊腺瘤屬于良性，不會對懷孕造成影響。而子宮內膜異位癥囊腫即巧克力囊腫，對妊娠存在一定影響，引起不孕癥發生率約40%。 巧克力囊腫指子宮內膜異位癥異位到卵巢，隨月經周期變化，可以脫落、出血，血液積聚在卵巢內部時間較長后形成融化巧克力樣物質。其可以影響盆腔微環境，影響卵子和精子受精，引起免疫功能改變，使女性產生抗子宮內膜抗體，影響受精、懷孕。巧克力囊腫女性還會出現盆腔粘連，影響輸卵管通暢度以及懷孕。