最常見的造成扁桃體疼的原因是急性扁桃體發炎。扁桃體急性炎癥最常見的原因是感染，同時伴有體質下降而造成的內火。 所以一旦發生急性扁桃體炎造成的扁桃體腫痛，建議患者進行抗生素治療，必要的時候可靜脈輸注抗生素，一般需應用7天左右，同時服用去火類中成藥來緩解由于上火而造成的扁桃體炎。 除了最常見的急性扁桃體炎造成扁桃體痛，部分慢性扁桃體炎也可以造成扁桃體痛。反復發作的慢性扁桃體炎，一般是由于急性扁桃體炎治療不得當而遺留形成的，如果1年急性發作3次還沒有好，造成慢性扁桃體炎，建議患者行手術治療。