甲狀腺過氧化物酶抗體是對抗體內的甲狀腺過氧化物酶。甲狀腺過氧化物酶在調節體內生物合成甲狀腺素即T3和T4的過程中，主要是促進甲狀腺球蛋白酪氨酸碘化的作用。實際上甲狀腺過氧化物酶抗體就是甲狀腺微粒體抗體的主要活性成分，所以基本上在臨床中可以把它等同于甲狀腺的微粒體抗體。甲狀腺微粒體抗體是橋本氏病或者橋本氏甲狀腺炎的一個標記物的抗體。橋本氏病的病人，微粒體抗體和球蛋白抗體都有升高的表現。所以甲狀腺抗過氧化物酶抗體升高，多數提示病人有橋本氏甲狀腺炎，需要通過球蛋白抗體的檢查以及超聲驗證來進一步確診這個疾病。