便秘的患兒會有腹痛，便秘由各種原因引起腸蠕動異常導致，腸蠕動異常也會導致腹痛。正常情況下食物從口腔到胃、小腸、大腸，胃與腸道有規律蠕動，逐漸將吞下去的食物從小腸運輸到大腸再從肛門排出。 當各種原因引起腸蠕動減慢，糞便停留在大腸的時間較長，大腸吸收水分，糞便里的水分吸收多后大便較干結。干結的大便易堵塞腸腔，胃腸道仍正常蠕動，會產生腹痛表現，所以便秘的孩子會腹痛。有些孩子因腹痛到醫院就診，醫生發現孩子出現便秘，建議解決便秘，腹痛即可好轉，但部分患兒便秘無腹痛現象。