避孕藥基本為雌激素、孕激素，可以模擬人工周期治療月經不調。由于周期性雌激素和孕激素分泌不規律，導致月經不調。雌激素和孕激素是卵巢分泌，卵巢分泌受垂體和下丘腦調節。如果每個月經周期比較穩定，月經后雌激素分泌逐漸上升，內膜生長，到中間有排卵期。這時孕激素排卵后上升，雌、孕激素維持高位準備迎接妊娠，如果這時沒有受孕，雌、孕激素下降，內膜無法支持后來月經，是正常的周期。如果月經不調可能中間沒有排卵，或者由于內膜長息肉或者其他因素引起，這時吃避孕藥模擬人工周期，月經會比較準確。經過幾個療程抑制體內雌、孕激素分泌，讓人體的下丘腦-垂體-卵巢軸休息一段時間，可能會逐漸調整。如果內膜不平整或者息肉導致月經不調，吃避孕藥也會抑制內膜生長，息肉可能會脫落，達到治療的目的。