小兒先天性心臟病應在出現肺動脈高壓前進行手術治療，避免對肺血管造成損傷。一旦發展為肺動脈高壓，則從功能性病變轉變為器質性病變，因此需立即手術治療。多數患兒術后肺動脈高壓癥狀可得到及時緩解，少數患兒需在一定時間內持續服藥。少數患兒無法進行手術治療，則需長期服藥，對其機體產生明顯影響，且為生活帶來不便，因此若確診新生兒出現先天性心臟病，則應選擇合適時間，在患兒能夠承受的情況下盡早進行手術治療。