肝臟膿腫由于是細菌性肝膿腫，實際上手術治療不是首選的治療手段，因為肝臟膿腫會造成肝組織壞死形成膿液，一般通過超聲介入的方法置管引流，同時結合生理鹽水沖洗，一般病人的膿腫會很快吸收。在特殊情況下，由于炎性腫塊不能夠液化，最終形成炎性假瘤，而且經過抗炎治療之后病情遷延不愈，病程一般超過3個月以上，會建議病人做手術切除，將炎性病灶連同周圍的部分肝臟組織做肝段的切除。因為肝膿腫是良性疾病，因此很多病人對手術比較抗拒，但是在少部分病人當中，如果是反復發作，病人反復出現肝膿腫，多數提示病人免疫功能下降，甚至是有些合并糖尿病。因此，肝膿腫的治療既要做局部治療，也要做全身治療，包括增強免疫功能，甚至針對原發病做進一步治療。