甲狀腺癌相對于其它系統的惡性腫瘤，治愈率較高，且預后良好。但如果在早期發現后未及時治療，頸部的腫塊壓迫到氣管，可引起窒息的不良后果。頸部淋巴結增大后，也會侵犯到血管和神經，引起聲音嘶啞、飲水嗆咳等癥狀。如果出現全身遠處轉移后，可出現相應并發癥，比如向肺部轉移后，可影響到呼吸系統，出現呼吸困難等癥狀；骨轉移后可引起疼痛、骨折等。特殊類型的甲狀腺癌，可引起血鈣變化，導致抽筋等癥狀，嚴重時影響肝腎功能，甚至危及生命。